垃圾桶因为要接纳各种各样的废弃物，每天都被细菌、病毒、霉菌包围着，从而污染室内环境，因此也是一个极易藏污纳垢的“细菌窝”。国际食品包装协会副会长董金狮指出，要想确保居家健康，垃圾桶在选择、摆放和清洁方面都要特别注意。
首先，在购买垃圾桶时，尽量选择不锈钢和竹编材质的。目前市面上的一些垃圾桶由于塑料材质来源不清，可能会带有一些放射性物质或有害挥发性物质，存在一定的隐患，但不锈钢和竹编的不仅少有此类问题，也容易清洗。另外，小一点的垃圾桶，可以促使人们勤倒垃圾，缩短了病菌滋生的时间。
其次，从放置来说，家中的垃圾桶放两个就够了。放多了既占地方，又增加污染的比例，一般厨房、客厅各放一个即可。厕所马桶如果冲水功能较好的话，便后的卫生纸可以直接用厕水冲走，没必要再放垃圾桶了。如果觉得实在不方便，可以放一个有盖的小垃圾桶。垃圾桶还要放在通风较好的地方，以便及时散去垃圾产生的气味。